Η ΕΕΤΤ εποπτεύει και ελέγχει τη νόμιμη χρήση του φάσματος ραδιοσυχνοτήτων και σε περιπτώσεις που διαπιστώνει παραβάσεις, επιβάλλει κυρώσεις. Διαθέτει το Τμήμα Σχεδιασμού Εποπτείας Φάσματος και τα Τμήματα Εποπτείας και Ελέγχου Φάσματος σε Αθήνα, Θεσσαλονίκη, Ηράκλειο Κρήτης και Πάτρα τα οποία είναι αρμόδια για θέματα εποπτείας και ελέγχου φάσματος ραδιοσυχνοτήτων.
Η ΕΕΤΤ διαθέτει κλιμάκια που διενεργούν καθημερινά ελέγχους, είτε αυτεπάγγελτα είτε κατόπιν καταγγελιών, λαμβάνοντας υπόψη την κρισιμότητα των προβλημάτων, π.χ. παρεμβολές σε δημόσια δίκτυα ηλεκτρονικών επικοινωνιών. Επίσης, κλιμάκια επιφυλακής λειτουργούν καθ’ όλη τη διάρκεια του έτους και σε εικοσιτετράωρη βάση. Στόχος είναι η άμεση αντιμετώπιση παρεμβολών που ενδέχεται να προκαλέσουν προβλήματα στα συστήματα αεροναυτιλίας, ναυσιπλοΐας, σωμάτων ασφαλείας και σωμάτων στρατού, θέτοντας σε κίνδυνο την ασφάλεια της ανθρώπινης ζωής.
Για τις ανάγκες της εποπτείας και ελέγχου του φάσματος, η ΕΕΤΤ διαθέτει ειδικό εξοπλισμό, ο οποίος αποτελεί τμήμα του Εθνικού Συστήματος Διαχείρισης και Εποπτείας Φάσματος (ΕΣΔΕΦ).
Σε περίπτωση που διαπιστωθεί παράβαση, ενεργοποιείται η διαδικασία επιβολής διοικητικών κυρώσεων (Ν.4727/2020, άρθρο 138). Επίσης, προβλέπεται η επιβολή ποινικών κυρώσεων για την παράνομη χρήση ραδιοσυχνοτήτων (Ν.4727/2020, άρθρο 138 και Ν.4635/2019, άρθρο 37), με ενδεχόμενη κατάσχεση του τεχνικού εξοπλισμού που χρησιμοποιήθηκε.
